Горы Средней Азии весьма богаты минеральными, в том числе термальными, источниками, имеющими бальнеологическое значение: в Иссык-Кульской котловине (Чолпон-Ата, Джети-Огюз, Теплоключенка), Киргизском хребте (Иссык-Ата), в Заилийском (Алма-Арасан), Джунгарском (Копало-Арасан), в Западном Тянь-Шане (Сары-Агач) и Западном Памире (Гарм-Чамша), в Таджикской котловине (Оби-Гарм) и в предгорьях Копетдага (Арчман) и др.

Гидроэнергетические ресурсы рек используются еще недостаточно, хотя на крупных реках создаются каскады гидроэлектростанций. На Нарыне созданы Ат-Башинская, Учкурганская, Токтогульская, Курпсайская ГЭС, сооружаются Таш-Кумырская и Шамалды-Сайская ГЭС, проектируется еще ряд ГЭС на самом Нарыне и его притоках. На Вахше построена Нурекская ГЭС с плотиной почти 300-метровой высоты и Байпазинская ГЭС, сооружается Рогунская, а всего Вахшский каскад будет иметь семь ГЭС. Сооружены ГЭС и на других реках Тянь-Шаня и Памира: Фархадская и Кайраккумская – на Сырдарье, на Чирчике, Варзобе, Карадарье, Или, на р. Гунт (Западный Памир). На Памире в настоящее время работает семь ГЭС.

Водные ресурсы горных рек используются для орошения и обводнения земель как в межгорных котловинах, предгорьях и низкогорьях, так и на Туранской равнине. Для накопления вод и регулирования стока рек созданы Фархадское, Кайракульское, Андижанское водохранилища – в Ферганской котловине, Южно-Сурханское и Шерабадское – в Таджикской депрессии, здесь же через Дангаринский ирригационный туннель подаются на орошение воды из Нурекского водохранилища. Тасуткольское водохранилище на р. Чу, Кировское на Таласе, Орто-Токойское на р. Чу, Чарвакское на Чирчике и другие обеспечивают полив земель в низкогорьях и предгорных равнинах краевых частей гор. Построены крупные ирригационные каналы: Большой Ферганский, Южный и Северный Ферганские, Большой Наманганский, Большой Чуйский, Большой Алма-Атинский, Большой Гиссарский, Вахшский и др.

Ресурсы земледелия определяются южным положением гор, продолжительным безморозным периодом, плодородными почвами и наличием водных ресурсов для орошения полей. Низкие котловины, предгорные и низкогорные районы являются, наряду с Туранской равниной, богатейшими в СНГ по количеству света и тепла. Сумма температур выше 10 °С здесь составляет 3500-4000°, а в Таджикской и Ферганской котловинах, предгорьях Копетдага и Гиссарского хребтов – более 4500°. Это позволяет выращивать при искусственном орошении субтропические растения (хлопчатник, кунжут, рис, арахис и др.), южные плодовые, виноград и бахчевые культуры. Посевы лучших сортов хлопчатника размещены на высотах до 1000 м. Выше, где тепла для субтропических культур недостаточно, а количество осадков увеличивается, развито богарное земледелие. Здесь выращивают зерновые, табак и картофель, развито садоводство.

В горах Средней Азии и Казахстана земледелие поднимается до таких высот, на которых в других горных странах СССР размещены вечные снега и ледники. В Тянь-Шане до высоты 2600-2750 м возделывают пшеницу, ячмень и картофель. На Западном Памире виноград выращивают до высоты около 2000 м, абрикосы – до 2700 м, а ячмень и горох – до 3500 м. Для растений, выращенных в высокогорных районах Памира, характерно повышенное содержание витаминов и сахара.

Растительные ресурсы представлены преимущественно горными пастбищами. Они весьма различны по урожайности и качеству кормов, а также по возможным срокам использования. Высокогорные субальпийские и альпийские луга используются в качестве летних пастбищ. Особенно высоко ценятся кобрезиевые луга, отличающиеся наибольшей урожайностью (до 25 ц/га) и высокими кормовыми качествами. Высокопродуктивными летними пастбищами являются также бобово-разнотравно-типчаковые травостои лесолугово-степного пояса, дающие урожаи до 12-15 ц/га. Правда, в составе травостоя здесь значительное участие принимают не поедаемые и ядовитые растения. Типчаковые и типчаково-ковыльные степи дают урожай от 5-6 до 8-9 ц/га. Подгорные эфемерово-полынные и низкогорные пырейно-разнотравные пастбища используются в весенне-раннелетнее время. Местами травостой пригоден для сенокошения. В горах наблюдается резкая диспропорция между осенне-зимне-весенними и летними пастбищами. Площади летних пастбищ, где скот может выпасаться лишь в течение 3-4 месяцев, значительно превосходят площади зимних и весенне-осенних пастбищ. В результате часть летних пастбищ остается неиспользованной. На Восточном Памире и во Внутреннем Тянь-Шане, где мала мощность снега, скот выпасается в течение круглого года.

Большое значение имеют дикорастущие ореховые леса, миндальники и фисташники. В них производится сбор плодов. Свыше половины общесоюзной площади лесов из грецкого ореха сосредоточено в Киргизии, здесь же находится 2/3 площади миндальников. Фисташников больше всего в Таджикистане.

Горные леса имеют большое водоохранное и почвозащитное значение, однако их площади сильно сократились в результате нерационального использования, поэтому важной проблемой является восстановление лесных массивов и расширение их площадей.